Beliau ditabalkan sebagai raja atau "Kabaka" Buganda setelah kemangkatan ayahandanya pada usia 15 tahun di luar Lubiri Mmengo tanggal 26 November 1939. Kerajaan baginda dipangku suatu Majlis Raja (Council of Regents) sehingga beliau cukup umur untuk memerintah.[2] Mutesa dimahkotakan di Buddo ketika berusi 18 tahun pada 19 November 1942.